Укладка морской части газопровода производилась отдельными секциями с впечатляющей скоростью. В этом процессе была задействована целая флотилия самых современных судов, работающих в рамках четко проработанного логистического плана на основе результатов обширных изысканий.
Различия в топографии морского дна на разных участках маршрута газопровода потребовали проведения подготовительных работ до начала укладки. Они включали, например, устройство каменной наброски на неровных участках морского дна. На мелководье у берегов России и Германии газопровод был заглублен в морское дно. Для этого были выполнены дноуглубительные работы и обратная засыпка для предотвращения воздействия от перемещения водных масс и песка. В местах пересечения газопроводом линий существующих инфраструктурных объектов, таких как телекоммуникационные и силовые кабели или другие газопроводы, были смонтированы специальные переходы.
После двух мировых войн в Балтийском море было захоронено множество боеприпасов, поэтому маршрут газопровода был оптимизирован таким образом, чтобы по возможности обойти зоны расположения неразорвавшихся боеприпасов (НРБ). Это позволило предотвратить какое-либо их воздействие на строительство и эксплуатацию газопровода и на ценные объекты культурного наследия. Боеприпасы, остававшиеся в коридоре прокладки газопровода, были обезврежены с использованием эффективных методов минимизации воздействия на окружающую среду, хотя применение не использующих якоря трубоукладчиков с системой динамического позиционирования во многих случаях снижало необходимость ликвидации боеприпасов.
Созданные вокруг объектов культурного наследия зоны отчуждения обеспечили их защиту от воздействия строительных работ.
Укладка газопровода осуществлялась самыми современными судами, работавшими в круглосуточном режиме на различных участках маршрута. Доставка труб из стратегически расположенных логистических центров обеспечивала бесперебойную работу этих плавучих заводов, позволявших сваривать трубы и укладывать готовую плеть на дно со скоростью до трех километров в день.
После завершения укладки с помощью специальных исследований были выявлены места, где газопроводу требуется дополнительная поддержка, стабилизация или защита посредством каменной наброски или углубления дна. После завершения строительства будут проведены дополнительные испытания, а вводу в эксплуатацию будет предшествовать независимая проверка и сертификация.
